Os cursos de mestrado e doutorado (Stricto Sensu) são: Doutorado e Mestrado em Engenharia de Alimentos, Doutorado e Mestrado em Direito, Mestrado em Ecologia, Doutorado e Mestrado em Educação, Mestrado em Ensino Científico e Tecnológico, Mestrado em Gestão Estratégica de Organizações e Mestrado em Atenção Integral à Saúde .